顺应潮流:仅血红蛋白ctDNA-MRD检测的应用前景!

2022-01-31 06:04:29 来源:
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"底物被划定MRD侦测的实用价值是明确的,愿意这些进展将继续提更高更进一步MRD侦测的效能。"

肺癌的MRD侦测是一种灵敏且特异的可用系统对肺癌病患者血液中的源性遗传物质(如ctDNA)相对数量的原理。在这种状态下,病患者没有肉眼可见的结膜,但似乎实际上标准病理影像原理不曾能侦测到但最终就会加剧肺癌病情恶化的细微结膜。

MRD,常称为细微残留结膜(Minimal Residual Disease)。常用“Minimal” (细微)这个词,是因为它在文献和病理科学界中的更常用。不过,“Minimal”这个词不太可能带有“误导性”,因为经常性的病变在预后和外科手术协调方面也不太可能带有重要意涵。“Measurable”(可精确测量)一词可更正确地地描述残留在病患者体内的免疫细胞的实际上。NCCN指南同时常用了“Minimal Residual Disease”(细微残留结膜)和“Measurable Residual Disease”(可精确测量残留结膜)两个术语。

此外,建议书工作表明在分子合构水平上侦测多种肺癌各种类型的ctDNA除此以外带有病理效用,文献和病理科学界有时也就会常用“Molecular Residual Disease”(分子合构残留结膜)一词。

近年来,国内外在单一中的基于ctDNA的MRD审核(ctDNA-MRD)的病理资料和确凿越发多,开启了单一瘤MRD侦测的热潮。单一瘤ctDNA-MRD侦测的更高效率流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情数据分析)

对原发第一秘密组织同步进行DNA以鉴定病患者的特异基因第举例来说变异图谱,然后内部设计引物定制panel或常用分开panel同步进行定制的ctDNA侦测数据分析。

2)Tumor-uninformed assays(不知情数据分析)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无需原发第一秘密组织,至少明确来说一第举例来说定时敲定引物/样品内部设计的与肺癌各种类型就其的分开panel同步进行ctDNA侦测数据分析,常在侦测ctDNA性状的同时,则有ctDNA底物或片段第举例来说精研等多第举例来说精研原理。弥补了第一秘密组织比对太低或系统对亚基太低或TAT可可能会等问题。

Tumor-informed assays的更高效率解决方案更符合另类的认知,在保证更高专一性的理论上下,可通过系统对多亚基的sample-level(比对水平)进一步提更高其敏感度,更高效率当选者相对来说不是特别更高。Tumor-uninformed assays的更高效率解决方案更类似于早筛,通过提更高site-level(亚基水平)侦测敏感度并则有ctDNA底物或片段第举例来说精研并合合机器精研习算法进一步提更高其敏感度和专一性,更高效率当选者相对来说更高。

2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》该网站公开发表了“至少常用胆红素ctDNA侦测合肺癌病患者细微残留结膜(MRD)”的评论,首次公开了Guardant Reveal的研究工作资料:MRD侦测敏感度达到91%,专一性达100%,这些发现大力支持了至少胆红素ctDNA-MRD侦测(Tumor-uninformed assays)的潜在病理技术的发展。

2021年8月13日,《Clinical Cancer Research》该网站公开发表了“顺应潮流:至少胆红素ctDNA-MRD侦测的技术的发展前景”的评论,在这里研究工作者们辩论审核了至少胆红素ctDNA侦测MRD的控制能力,以及将底物构建到ctDNA侦测的潜在好处。2

Parikh及其熟人1 和Taieb及其熟人3 辩论了至少胆红素ctDNA-MRD侦测在合肺癌(CRC)病患者中的的潜在病理技术的发展。

▲ ctDNA底物和性状在两项研究工作中的的技术的发展相对来说较(Parikh和Taieb)

合肺癌(CRC)的外科手术即使如此陷入着一个单打独斗,即极多的CRC病患者因晚期疾病病情恶化而而会死亡。尽管病理采用了标准的常规外科手术,但更高安全性IIIC期CRC病患者的5年生存率也至少有53%,究其原因是没有发现影像精研上不曾侦测到的细微残留结膜(MRD)。4

目前,仍迫切须要正确地确认哪些病患者术后实际上MRD,以帮助指导减少或上升常规外科手术,并上升绝症的不太可能性,同时最大限度地减少可可能会外科手术的就其毒性。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和预后中的的技术的发展有了广泛的探究。目前,基于ctDNA的MRD审核正广泛应可用肺癌的外科手术中的。

ctDNA是由DNA的动画短片段第一合组(有约130-150bp),由免疫细胞通过介导、坏死或分泌释放到肺部中的。 ctDNA的钫较宽致使其成为敏感的实时负荷;也,它的实际上不太可能反映了影像精研上看不见的微转移。

在绝症性外科手术合束后,ctDNA中的出现的体细胞性状对随后的影像精研病情恶化带有更高的感染性数据分析价值,特别是当这些性状与开刀的第一秘密组织中的的性状相匹配时。侦测这种ctDNA下定义的MRD可以在I-III期CRC中的提前影像精研数月数据分析病情恶化,从而为一第举例来说最终就会病情恶化的CRC病患者以外一个审核新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基本概念性状下定义的MRD侦测原理的敏感度即使如此是有限的,迫切须要改进型其侦测效能。

ctDNA的底物侦测优于ctDNA的基本概念性状侦测。ctDNA的底物极其在CRC中的并不常用,并被视为大多数癌变的晚期阶段。这种底物,明确下定义为DNA中的胞嘧啶的C5位置添加羟基基团,抑制不远处基因的表述,以外经典的抑基因序列失活。与基本概念性状相对来说,CRC中的实际上更多的底物极其区域,为提更高MRD侦测的敏感度以外了机就会。SEPT9,就是第一个利用血液侦测单基因底物极其同步进行筛查和晚期侦测CRC的原理。尽管ctDNA底物有这些优点,但这些相同的物理性质也须要谨慎,以保持良好侦测数据分析的专一性,并尽量减少假感染性的不太可能性。

在这种文化背景下,Parikh和Taieb的正因如此最新研究工作合果为我们对ctDNA效能的理解以外了有用的补充,即无需原发第一秘密组织,至少通过血液ctDNA底物或联合ctDNA性状即可同步进行正确地的MRD审核。与其他须要对原发第一秘密组织同步进行DNA以指导先前ctDNA数据分析的侦测不同,正因如此研究工作探讨了Tumor-uninformed assays的有效性,它有几个占优,以外较慢的TAT,降低初始生产成本,对第一秘密组织太低或不可用的病患者同步进行系统对。

Parikh等人以外了一种ctDNA底物合合ctDNA基本概念性状的分开panel同步进行MRD的数据分析审核(NGS原理),与其他商业上可用的MRD侦测原理相对来说,这种原理不须要开刀的第一秘密组织以及定制化。在最终外科手术后常用时,这种至少胆红素ctDNA-MRD侦测对病情恶化带有病理意涵的专一性(100%)和敏感度(55.6%),通过构建微小基因第举例来说特质和纵向系统对数据分析,其敏感度可进一步提更高至91%。1 该原理被可用正在同步进行的必要性研究工作,以外指导IIA期合肠癌外科手术协调的NRG合作第举例来说研究工作(NCT04068103)。虽然还须要额外的资料集来验证这些发现,但这些合果毫无疑问基于ctDNA的MRD侦测在不知情的情况下可拒绝接受的侦测效能特质。

Taieb等人的研究工作利用了一对在此之后被断言是CRC开刀后预后就其的底物基因标记物WIF1和NPY(ddPCR原理),并将它们应可用PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC病患者随机包含3个月 vs 6个月的常规化疗。在对参加III期试验的III期CRC病患者同步进行的首次ctDNA-MRD审核中的,有13.8%的病患者术后为ctDNA-MRD感染性,并被证实为独立的预后;也。3 同时,研究工作者也指出,与其他采用NGS原理的ctDNA-MRD研究工作相对来说,本研究工作中的ctDNA的感染性率更高。敏感度和PPV除此以外低于NGS侦测合果,ctDNA-MRD感染性和阴性的5年DFS分别为65%和73%,尽管常规外科手术的和不理想的前数据分析比对管控不太可能就会对这些合果产生受到影响。该原理值得注意的是其相对简单,并不低的生产成本和潜在的重演性,不须要商业侦测中的所见的专利侦测原理。正在同步进行的必要性研究工作将进一步审核至少胆红素ctDNA侦测是否能够正确地审核MRD,以便对CRC病患者同步进行安全性分层,并指导常规外科手术协调。

无论采用何种原理,至少用胆红素ctDNA-MRD侦测来指导CRC病患者的外科手术决定,须要准确且正确地的侦测原理。需进一步提更高至少胆红素ctDNA-MRD侦测的敏感度来确认哪些病患者可以从外科手术降级中的获益,以可能会不恰当地除此以外更高危病患者拒绝接受更高气压的外科手术。Parikh及其熟人的研究工作合果表明,构建基因第举例来说和微小基因第举例来说以及纵向胆红素系统对,可显著提更高至少胆红素ctDNA-MRD的敏感度。相对来说之下,ctDNA-MRD侦测的更高专一性对于ctDNA作为一个完整的生物;也来确认外科手术更新是至关重要的。由于专一性太低,假感染性的ctDNA-MRD不太可能就会使病患者拒绝接受可可能会的加速外科手术。Parikh及其熟人的研究工作合果断言,除基本概念性状外,还可以通过合合微小基因第举例来说底物特质的数据分析来保持良好专一性。Taieb等人的数据分析原理的占优在于提更高了病理特质的敏感度和预后,但是,正如研究工作者承认的那样,基本上的两个基因底物标记不太可能不曾能以外与合合基本概念性状原理的效能特质。重要的是,这项工作也强调了标准化数据分析前条件的重要性,因为各种提取原理可以在很大程度上受到影响ctDNA的得率和完整性。在不曾来的研究工作中的,这些数据分析前的选择将变得越发重要。

底物被划定MRD侦测的实用价值是明确的,愿意这些进展将继续提更高更进一步MRD侦测的效能。总之,至少胆红素ctDNA-MRD的侦测以外了一个奇特的机就会,常用一种无创原理来探索外科手术方案,并有不太可能根除更高危病患者的微转移性结膜。这些研究工作合果无疑为不曾来ctDNA-MRD指导的必要性病理试验铺平了道路。

MRD,即使如此是一个较慢转变的各个领域,我们预计近两年不太可能就会出现更进一步确凿,要么显示出MRD侦测的病理效用的局限,要么显示出MRD侦测的其他占优和新用途。

参考资料:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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